西南大学三个校区分别是北碚校区、荣昌校区、西塔学院，其中北碚校区是西南大学本部。
以下是三个校区的详细介绍。
1、北碚校区
北碚校区位于重庆市北碚区天生路2号，为西南大学本部，据2016年7月学校官网显示，西南大学本部占地面积8000余亩，校舍面积165万平方米建有校门8个、教学大楼40余栋、主要图书馆3个、运动场5个、体育馆3个、游泳馆3个（其中恒温1个）、篮球场3处、网球馆2个、食堂10余个、校医院2个、湖泊5个、广场8个、花园10个，还建有博物馆、校史馆、自然博物馆、历史博物馆、天文馆、地质馆、光大礼堂、学生活动中心、理科实验大楼、留学生大楼、跆拳道馆、西南大学宾馆、保利万和电影院等。
西南大学校园内历史文化建筑众多，有川东行署旧址、吴宓旧居等重庆市文物保护单位。
此外，校本部由7条线路的校园交通车（观光车）连接校内各大区域，全范围覆盖有校园网无线WIFI，学生生活区由桃园、李园、杏园、橘园、梅园、楠园、竹园等区组成。
2、荣昌校区
西南大学荣昌校区位于重庆市荣昌区学院路160号，占地526亩，为西南大学多学科高水平特色校区，在本科第一批次招生。荣昌校区始建于1938年，抗战时期为中央畜牧实验所、中央血清研究所、中央农业实验所所在地，解放后为国内著名的四川省荣昌畜牧兽医学校，1978年升建为四川畜牧兽医学院。2001年与原西南农业大学、中国农科院柑桔研究所合并，设立西南农业大学荣昌校区。2005年西南农业大学与西南师范大学合并，校区更为现名。
截至2016年5月，拥有全日制在校本科学生4500余人、硕士研究生200余人，网络和继续教育学生2800余人。常驻校区在职教职工近500人，其中教授、副教授150人具有博士、硕士学位195人国家高等教育教学指导委员、国务院特殊津贴专家、农业部兽药审评委员、重庆市学术带头人、突出贡献专家等30余人研究生导师80人。
3、西塔学院
西南大学西塔学院位于重庆市渝北区龙溪红石支路500号，鸿恩寺森林公园北面，毗邻重庆花卉园，占地105亩，在本科第一批次招生。
应用技术学院是西南大学从事全日制本科教育的学院，其前身为原重庆市轻工业局隶属的重庆轻工业职工大学，于2000年8月并入西南师范大学。西塔学院是由西南大学与澳大利亚西澳大学、塔斯马尼亚大学同时冠名合作的本科联合培养学院，为二级教学科研单位，正处级建制，开设经济学、生物技术、电子信息工程和食品质量与安全四个专业。
